46亿年前，与地球一同诞生的病毒军团，以乌卡卡为首，为了夺回被人类抢走的地球主导权而攻击人类。此时，继承了抗病毒基因的四位英雄，化身为纳米战士洛卡帕红、蓝、粉、玉，作为人类的守护神，与巨型洛卡帕机器人一同守护地球和人类的生命。