遥远的宇宙，珀伽索斯星系。这里是零与一构成的编码星。在这里，梅索德王与阿尔伯特王子一同和平地统治着美丽的编码星。然而，病毒蠕虫和特洛伊唤醒了卡斯帕封印的病毒大魔王克拉卡，企图用病毒染黑编码星！与此同时，地球少年里奥将寻找外星人的程序发送到宇宙，但编码星上寻找卡斯帕的信号却意外地与里奥的信号连接上了。阿尔伯特、里奥和贾比能否找到立方体，封印克拉卡，拯救编码星和地球呢？