《爸爸的四重奏》的主人公爸爸道河，曾是人气爆棚的四人组合“爸爸的四重奏”的吉他手兼主唱。然而，一场意外让他永远失去了挚爱的妻子，世上只剩下他与唯一的家人——挚爱的女儿彩麟相依为命。但由于过去的事故，爸爸的身体因烟酒和抑郁而每况愈下。女儿看着爸爸颓废的样子，对他态度十分冷漠，用尖刻的话语刺伤他。有一天，爸爸突然昏迷不醒。接到爸爸晕倒的电话后，女儿赶往医院，却意外来到了一个奇怪的地方。那里竟然是爸爸的身体内部……！在那里，她遇见了爸爸的各个器官，并明白了爸爸身体抱恙的真正原因……