#1. 探险队与热带雨林救援行动。前往亚马逊雨林探险的海底小纵队队员“敏”发现河流凭空消失，预感事情不妙。不仅如此，本应栖息在树冠层的怪僻“叫猴”群也向下迁移，试图将“敏”赶走……接到“敏”的警报后，海底小纵队火速赶往热带雨林！ #2. 探险队与鳄鱼对鲨鱼的对决。鲨鱼群出现在鳄鱼的栖息地沼泽？！原来是盐度升高的湿地吸引了鲨鱼。被夹在势均力敌的鳄鱼与鲨鱼之间的“卡吉”和队员“波妮”，能否为它们找到各自合适的家园？ #3. 探险队与孤独的青蛙。在调查玻利维亚湿地河流的“波妮”遇到了一只唱着“我好孤单~”的稀有水蛙。为了给濒临灭绝的水蛙找到朋友，“波妮”拉响了警报。海底小纵队乘坐形似乌龟的新探险船“陆地巡航艇4号”出动了！ #4. 探险队拯救可可树。全球性问题(?)发生，可可豆同时掉落到海底总部和队员们的基地。为了解决紧急事态，巴克队长前往亚马逊。他们将乘坐细长的“陆地巡航艇5号”，展开一场可爱巴克队长的勇敢探险！