4,6 миллиарда лет назад армия вирусов, существовавшая с момента зарождения Земли и возглавляемая Укакой, атакует человечество, чтобы вернуть себе господство над Землей, отнятое людьми. В этот момент четверо героев, унаследовавших ген противовирусной защиты, становятся Нано-воинами Рокапа Красный, Синий, Розовый и Нефритовый, и как боги-хранители человечества защищают жизнь Земли и людей вместе с гигантским роботом Рокапа.