ついに始まった第100回ランニングマンチャンピオンシップ。各部族を代表して出場した7人のランニングマン。一次戦の「バブルハンター」ではバグ族代表のリウが勝利を収め、続く二次戦「超能力バトル」。それぞれに与えられた超能力を駆使して競い合うサバイバルゲーム。繰り返される連合と裏切りの中で、最後までシールドを守った選手は、バルス族代表のクーガだった。そして真夜中、メインスタジアム地下の研究室では、大会主催者のチャーミングゴールドが見守る中、尋常ならざる出来事が起こっているようだ。一方、ランニングマンたちは休暇を受けて列車旅行に出かけるが、殺人事件に巻き込まれるかと思いきや、ついに列車内がゾンビで満たされる騒動まで起こる。ワクチンを探して貨物室に走るランニングマンたち。そして列車が向かう終着駅では、思いもよらない出来事が待っていた…。