6500万年の眠りから目覚めたティラノサウルスと偶然にも交感することに成功した少年「ジン（キム・ソジン）」は、地球防衛軍団を養成するディアマー・アカデミーにリンカーとして特別入学する。ジンは、ティラノサウルスとの交感訓練、操縦訓練、仮想戦闘訓練など、様々な訓練を開始する。その後、「セナ（ジス）」、「アイン（ムン・ソヒ）」、「ヨンフ（イ・セオン）」など、他のディアマー・リンカーたちとチームを組み、共に成長していく。そんなある日、地球に落ちたエターナル・コアを狙っていた機械恐竜帝国が地球を侵略し、カイザー軍団はその隙を狙ってディアマーを攻撃し、エターナル・コアを奪おうとする。これに対し、ディアマー・リンカーたちは力を合わせ、彼らを阻止することに成功する。しかし、機械恐竜帝国のNo.2である「フラウトゥス」が登場し、絶体絶命の危機に瀕することになる…。果たして、ディアマー・リンカーたちは最強のヴィラン「フラウトゥス」に立ち向かい、地球を守り抜くことができるのだろうか！