Setelah pembebasan, pembantaian massal warga sipil di Korea Selatan dimulai dengan insiden tambang batu bara Hwasun pada Agustus 1946 dan pemberontakan Oktober Daegu. "Pemberontakan Oktober" di Daegu, yang terjadi di bawah pemerintahan militer AS dan meluas ke seluruh Korea Selatan, adalah "sebuah insiden yang dipicu oleh warga sipil dan sebagian kekuatan sayap kiri, yang tidak puas dengan perekrutan pejabat pro-Jepang oleh pemerintahan militer, penundaan reformasi tanah, dan pelaksanaan kebijakan penyitaan makanan secara paksa, yang menentang polisi dan otoritas administratif". Insiden ini adalah pendahuluan dari pembantaian warga sipil berikutnya, karena para kolaborator pro-Jepang yang telah menindas dan mengeksekusi tentara kemerdekaan anti-Jepang menjadi kepala polisi dan lembaga negara di bawah pemerintahan militer AS tanpa dibersihkan, menandai dimulainya sejarah anti-sejarah. Jalan menuju kelangsungan hidup yang ditemukan oleh para kolaborator pro-Jepang, yang seharusnya dibersihkan, dengan bersandar pada pemerintahan militer AS dan Syngman Rhee adalah pemusnahan kaum komunis. Untuk menutupi tindakan pro-Jepang mereka dan bertahan hidup, mereka mulai menyingkirkan para penentang pemerintah, kekuatan sayap kiri, dan kaum nasionalis. Menurut jajak pendapat pemerintahan militer AS pada tahun 1946, sekitar 78% penduduk Korea Selatan menginginkan sosialisme, dan hanya sekitar 14% yang menginginkan kapitalisme. Dalam situasi ini, rezim Syngman Rhee, yang tidak mendapat dukungan rakyat, menunjuk orang-orang pro-Jepang dan tokoh-tokoh sayap kanan untuk membantai kelompok-kelompok dan warga sipil yang menghalangi secara politik. Setelah pemberontakan Jeju 4.3 pada tahun 1947 dan insiden Yeosu-Suncheon pada tahun 1948, rezim Syngman Rhee memulai pembangunan negara anti-komunis dengan menyingkirkan sayap kanan konservatif dan kekuatan sayap kiri. Dengan pecahnya Perang Korea, pembantaian massal warga sipil semakin intensif. Liga Perlindungan Rakyat (Gukmin Bodo Yeonmaeng), yang didirikan untuk membimbing dan mencerahkan elemen-elemen sayap kiri, menjadi sasaran pembantaian skala besar di awal Perang Korea. Militer dan polisi keturunan pro-Jepang juga melakukan pembantaian yang lebih kejam demi kelangsungan hidup mereka sendiri. Amerika Serikat, yang mengambil alih komando operasional perang selama Perang Korea, juga menjadi pelaku pembantaian warga sipil. Selama periode ini, pembantaian warga sipil juga dilakukan oleh Tentara Rakyat yang mundur, kantor keamanan dalam negeri, dan kekuatan sayap kiri lokal.