Cinq Space Cops sont chargés de protéger la paix de tout l'univers, y compris la Terre. Cependant, la paix prolongée dans l'univers a conduit à un relâchement de la discipline des Space Cops. Le commandant Master King expédie les Space Cops, qui ont échoué dans leur mission de garde, dans une station de métro délabrée. C'est alors que Serpent, qui a envahi la Terre, libère le diabolique monstre Dévil Monster Sep pour menacer la Terre. Le quartier général de l'Alliance Terrestre déclare l'état d'urgence, mais Serpent est trop puissant et ils sont repoussés. L'humanité est confrontée à une crise majeure. Pendant ce temps, Kai, un garçon à la recherche de ses parents archéologues, rencontre par hasard les Space Cops et devient leur ami. Avec Kai, les Space Cops cherchent les os de leurs Gardiens - Phoenix, Rhino, Puma, Reindeer et Cobra - pour les ressusciter, et tentent d'arrêter Serpent et sa bande pour les transférer dans une prison spatiale. Parviendront-ils, malgré leurs nombreuses erreurs, à retrouver les os des Gardiens et à arrêter Serpent et sa bande ?