Durante un ejercicio conjunto entre Corea del Sur y Estados Unidos, Chan-seok, el segundo al mando del submarino Jang Bogo, mata al capitán enloquecido y es condenado a muerte. Chan-seok, que creía haber sido ejecutado, despierta en un lugar desconocido. Tras las crípticas palabras de 202, descubre el submarino nuclear secreto 'Fantasma'. El submarino nuclear 'Fantasma', que el gobierno recibió en lugar de un préstamo de la Unión Soviética, comienza su travesía con una tripulación fantasma cuyos registros han sido borrados, quedando solo sus números. El capitán, desconfiando del segundo 202, le entrega a Chan-seok la llave de lanzamiento de misiles nucleares antes de ser asesinado. Chan-seok se entera de que el propósito del viaje del 'Fantasma' es una orden de autodestrucción del gobierno, que ha cedido a la presión de las potencias. A 600 metros de profundidad, bajo una tecnología probada por primera vez en Corea, comienza el enfrentamiento entre 202, que se rebela contra el capitán, y Chan-seok, que intenta detenerlo...