„Der Wunderpfiff der Hexe“ ist eine Landschaftsdokumentation, die auf Tokio zurückblickt, während es sich auf die Olympischen Sommerspiele 2020 in der Reiwa-Ära vorbereitet. Der Film wechselt zwischen der Geschichte, die die Lebensspanne von Robotern und Menschen vergleicht, die am Unfallort der Nuklearkatastrophe von Fukushima eingesetzt wurden, dem Roman „Die Wiederholung“ von Peter Handke und Monologen, die aus Briefen an einen Freund in Tokio bestehen, und beschreibt das kurz vor der Fertigstellung stehende neue Olympiastadion.